я так понимаю стоит на одном харде? тогда запускаем fdisk с нужным диском (если один хард и сатовский то /dev/sda, если ide то /dev/hda) потом смотрим на каком разделе стоит загрузчик линуха (если бут раздел не отдельный то root раздел отвечает за загрузку) жмем a вбиваем номер раздела, и потом снимаем загрузку с вынь раздела.
Ну и в зависимости от загрузчика настраиваем выбор системы уже в линухе.