Насчет "бесплатного", предыдущий афтар правильно сказал, почти всегда можно найти таблетку.
А так, FTP клиент - это твой инструмент.
А подборка инструмента - дело индивидуальное.
Если делаешь серьезную работу, соответственно и инструмент нужен серьезный.